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缓慢非细菌性前列腺炎病因十分复杂，大都学者认为其主要病因可能是病原体感染、炎症和反常的盆底神经肌肉活动和免疫反常等共同效果成果。
1、病原体感染
本型患者虽然惯例细菌查看未能别离出病原体，但可能依然与某些特殊病原体：如厌氧菌、L型变形菌、纳米细菌、或沙眼衣原体、支原体等感染有关。
2、排尿功用障碍
某些要素引起尿道括约肌过度收缩，导致膀胱出口梗阻与剩余尿构成，形成尿液反流入前列腺，不仅可将病原体带入前列腺，也可直接影响前列腺，诱发无菌的“化学性前列腺炎”。
3、精力心思要素
经久不愈的前列腺炎患者中一半以上存在明显的精力心思要素和人格特征改动。如焦虑、压抑、疑病症、癔病，乃至自杀倾向。这些精力、心思要素的改动可引起植物神经功用紊乱，形成后尿道神经肌肉
功用失调，导致骨盆区域痛苦及排尿功用失调;或引起下丘脑-垂体-性腺轴功用改动而影响性功用，进一步加重症状，消除精力紧张可使症状缓解或痊愈。但目前还不清楚精力心思改动是其直接原因，还是继发
表现。
4、免疫反应反常
近年研究显现免疫要素在缓慢非细菌性前列腺炎的发作发展和病程演变中发挥着非常重要的效果。
5、氧化应激
前列腺炎患者氧自由基的产生过多或/和自由基的清除体系效果相对下降，从而使机体抗氧化应激效果的反应能力下降、氧化应激效果产物或/和副产物添加。
6、盆腔相关疾病要素
间质性膀胱炎是可能的病因，前列腺外周带静脉丛扩张、痔、精索静脉曲张等是形成缓慢前列腺炎久治不愈的原因之一。
