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1、Ⅱ型单纯疱疹病毒特殊附着性，使得传统治疗很难攻克：生殖器疱疹的致病病毒、Ⅱ型单纯疱疹病毒(HSV)潜伏于神经节内，麻痹机体免疫调节机能，在机体各项免疫机能正常时时蛰伏待机，当机体调节机能紊乱，因炎症等免疫功能低下时，病毒迅速心活，危害组织器官，在治疗上药物很难从神经节内清理病毒，治疗同时对自身的损伤也较大。
2、Ⅱ型单纯疱疹病毒极具伪装性，诱导机体防御功能失常：临床表明Ⅱ型单纯疱疹病毒变异后可进行自我伪装，让机体无法识别，或者释放假信号避免药物和免疫系统对它的杀灭作用，给治疗带来很大不变，即使治疗也可能是暂时性的一种假象，很容易再次反复。
3、生殖器疱疹发病多合并其它疾病，临床治疗中易被忽视：在临床实际治疗中，生殖器疱疹往往不是单独发病，一般都是在其它炎症或隐性感染后发病。
4、人体自身免疫力弱：一般生殖患者的自身免疫力较弱，在经综合治疗，少数残余的病毒发生变异，人隐藏于神经细胞内，当患者免疫力下降时，如生病、发热、酗酒、劳累时，潜伏的病毒重新复活，开始繁殖，然后大量复制出新病毒，又沿神经轴返回皮肤黏膜，引起新的疱疹，病灶逐渐扩大，从而出现疱疹反复。
患者的困惑：传统方法治疱疹为何易反复?
由于病毒的特殊附着性，伪装性，复制和变异等特点，传统方法的治疗不但难度大，而且有些治疗方法和治疗药物而言，它对身体的伤害特别大，在一定区间内它对病毒的杀灭效果和对机体生理机能的损伤是成正比的。
在这种情况下，机体免疫系统的负担和压力也在增加，不但要杀灭病毒，而且要应对自身新的损伤，这是传统治疗当前还不能很好克服和避免的难题之一。
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