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临床上，很多疾病跟附睾炎的症状很相似，常见的有：
1.附睾结核：早期病变局限于附睾尾，后累及整个附睾。一般发病比较缓慢，不痛，输精管有串珠样改变。尿培养为结核阳性。
2.睾丸肿瘤：没有痛感，肿块与正常睾丸易于区别，前列腺液及小便常规检查均正常，必要时可以作组织病理检查。
3.精索扭转：常见于儿童，这就是跟附睾炎的区别，因为附睾炎“喜欢”青年人多见于儿童。扭转的早期，睾丸上提与附睾有清楚的界限;扭转的后期可能界限不清，如轻轻上推睾丸则发生疼痛，说明为精索扭转。
4.流行性腮腺附睾炎：伴有腮腺炎或腮腺炎病史，无尿路症状，小便检查无脓球或细菌。
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