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慢性附睾炎大多是由非特异性急性睾丸炎治疗的不好所致。也有的慢性附睾炎是由于霉菌、螺旋体、寄生虫感染等造成的，例如睾丸梅毒或既往有睾丸外伤者，可发生肉芽肿性附睾炎。此外，睾丸局部或全身放射性同位素磷照射，也可发生睾丸炎症，破坏睾丸组织。病理上说睾丸肿大或硬化萎缩，生精小管的基底膜呈玻璃样变及退行性变，生精上皮细胞消失。生精小管周围可能有硬化，也可形成小的增生灶。
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