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治疗前列腺炎首先要进行临床评估，确定疾病类型，针对病因选择治疗方法，心理治疗及调节性生活要贯穿治疗的全过程。对疾病的错误理解、不必要的焦虑以及过度节欲会使症状加重。前列腺炎可能是一种症状轻微或全无症状的疾病，可能是一种可以自行缓解的自限性疾病，也可能是一种症状复杂，导致尿路感染、性功能障碍、不育、大大降低生活质量的疾病，对患者的治疗既要避免向患者过分渲染本病的危害性，也要避免对本病治疗采取简单、消极、盲目偏重抗生素治疗的态度，应该从病因入手，进行综合治疗。
1、抗菌治疗
前列腺液培养发现已知的尿路致病病原体是选择抗菌药物治疗的依据。若发现泌尿生殖道罕见的病原体或共生菌，则不能确定为致病病原体。非细菌性前列腺炎患者若有细菌感染迹象，经一般疗法治疗无效，亦适宜采用抗菌药物治疗。抗菌药物的选择需注意前列腺腺泡与微循环间存在由类脂膜构成的前列腺-血屏障，妨碍了水溶性抗生素通过，大大降低了治疗效果。一些细菌分泌糖蛋白基质，阻碍了抗生素与细菌接近。当有前列腺结石存在时，结石可成为细菌的庇护体。上述诸因素构成了慢性细菌性前列腺炎治疗上的困难，需要较长的疗程，且容易反复。
过去常用的药物如复方磺胺甲恶唑抗菌谱广，但不能在前列腺内浓集，连续用药2个月疗效仍不满意。目前多主张内服喹诺酮类药物如氧氟沙星或左旋氧氟沙星。若无效继续用8周。反复且菌种不变，改用预防剂量以减少急性发作，使症状减退。长期应用抗生素若诱发严重副反应，如假膜性肠炎、腹泻，肠道耐药菌株滋长等，则需更换治疗方案。另一方案是先用四环素，若症状减轻，延长至28天，症状不减则改用喹诺酮类药物。
非细菌性前列腺炎是否适宜使用抗菌药物治疗，临床上仍有争论。有证据说明过去曾使用喹诺酮类药物的患者，前列腺液或前列腺按摩后尿培养有假阴性结果。沙眼衣原体和支原体可引起前列腺炎，而普通培养不会有阳性结果。而且有前列腺症状的患者，使用一疗程抗生素治疗，大约40%患者能取得疗效，因此，“无菌性”前列腺炎患者也适宜使用对细菌和支原体好的药物，如喹诺酮类药物，SMZ-TMP或单用TMP，与四环素、喹诺酮类药物并用或间隔使用。如果抗生素治疗无效，确认为无菌性前列腺炎者，则停用抗生素治疗。用双球囊导尿管封闭前列腺部尿道，从尿道腔注入抗生素溶液反流入前列腺管，亦可达到治疗目的。
2、消炎以及止痛药
非甾体抗炎药可改善症状，一般使用消炎痛内服或栓剂，中药使用消炎、清热、解毒、软坚药物亦收到一定效果。别嘌醇能降低全身及前列腺液中的尿酸浓度，理论上它作为自由基清除剂，还可清除活性氧成分，减轻炎症，缓解疼痛。不失为可选用的辅助治疗方法。
3、物理治疗
前列腺按摩可排空前列腺管内浓缩的分泌物以及引流腺体梗阻区域的感染灶，因此对顽固病例可在使用抗生素的同时每3～7天做前列腺按摩。多种物理因子被用作前列腺理疗，如微波、射频、超短波、中波和热水坐浴，对松弛前列腺、后尿道平滑肌及盆底肌肉，加强抗菌疗效和缓解疼痛症状有一定好处。
4、α-受体拮抗剂
前列腺痛、细菌性或非细菌性前列腺炎患者的前列腺、膀胱颈及尿道平滑肌张力都增加，排尿时后尿道内压增高致尿液反流入前列腺管，是引起前列腺痛、前列腺结石及细菌性前列腺炎的重要原因，应用α受体拮抗剂好地改善前列腺痛及排尿症状，对防止感染反复有重要意义。常用的药物有阿夫唑嗪、特拉唑嗪、坦洛新或竹林胺。α受体拮抗剂宜用较长疗程，使有足够时间调整平滑肌功能，巩固疗效。
5、手术治疗
外科治疗可用于反反复作的慢性细菌性前列腺炎。前列腺摘除能够达到治好的目的，但是要慎用。由于前列腺炎通常累及腺体的外周带，因此，前列腺电切术难以达到治疗的目的前列腺电切术能够去除前列腺的结石和前列腺导管附近的细菌感染病灶，有益于降低外周带病灶的再感染。前列腺炎可导致反复尿路感染及不育。
